当協会では、3つの柱（BRANDING・ART・PRINTING）を立てて活動しており、組織は事務局を加えて4局構造となっています。
BRANDING委員会
当協会において制作されたジークレーのブランド価値向上にむけた取り組みや、各権利保全業務について研究し対策していく委員会で、著作権法を専門とする専門家をはじめ市場価値創造にかかわる造詣の深い専門家が中心となって運営する委員会です。
ART委員会
ジークレーを新たな芸術分野の一つとして発展させていくための作画・技法の研究、またジークレー作品や作家の裾野を広げるための作品展などを企画する委員会で、画家や写真家などが中心となって運営しています。
PRINTING委員会
ジークレーのプリンティング技術に関する評価や技術・品質基準づくりとその研究、またジークレーのプリンティング専門技術者を養成し認定する委員会です。印刷・用紙・製版・インク・印刷機などの分野の専門家たちが中心となって運営しています。
事務局
当協会の事務処理全般をはじめ、ホームページの運営、ジークレーの普及支援のためのプランニングなどをしています。